W roku 1947 urządzono drewnianą kaplicę Świętej Rodziny w domu mieszkalnym przy ul. Poleskiej, podarowanym przez osoby prywatne Zgromadzeniu Sióstr Misjonarek Świętej Rodziny. W kaplicy tej, od roku 1955 aż do śmierci w roku 1975, pełnił posługę duszpasterską, i w ostatnich latach życia przy niej mieszkał, bł. ks. Michał Sopoćko.
W roku 1980 rozpoczęto prowadzenie ksiąg metrycznych, a w roku 1982 powstała Parafia Świętej Rodziny, obejmująca swym zasięgiem Osiedle Sienkiewicza i Osiedle Białostoczek. Jej pierwszym proboszczem został ks. Zbigniew Krupski, dotychczasowy duszpasterz kaplicy. Pod jego kierunkiem, na Osiedlu Białostoczek rozpoczęto budowę kościoła Miłosierdzia Bożego, i chociaż oficjalną siedzibą parafii pozostawała kaplica przy ul. Poleskiej, tam przez wiele lat koncentrowało się życie religijne parafii.
W roku 1990 na Osiedlu Białostoczek utworzono odrębną Parafię Miłosierdzia Bożego, a jej proboszczem został dotychczasowy proboszcz Parafii Świętej Rodziny, ks. Zbigniew Krupski. Proboszczem Parafii Świętej Rodziny, obejmującej od tego momentu tylko Osiedle Sienkiewicza, został ks. Józef Bielski, który wkrótce, u zbiegu ulic Ogrodowej i Fabrycznej, rozpoczął budowę plebanii i nowego, dwupoziomowego kościoła Świętej Rodziny, według projektu inż. arch. Danuty Łukaszewicz.

W roku 1998, gdy parafia od pewnego czasu korzystała już z dolnego kościoła przy ul. Ogrodowej, kaplica przy ul. Poleskiej została przekazana Zgromadzeniu Sióstr Jezusa Miłosiernego. Jej dotychczasowy tytuł „Świętej Rodziny” został zmieniony na „Błogosławionej Faustyny”, a w roku 2008 na „Świętej Faustyny Kowalskiej i Błogosławionego Michała Sopoćki”.
Kolejni proboszczowie parafii prowadzili prace budowlano-wykończeniowe na plebanii i w kościele, została powiększona i uporządkowana posesja przykościelna. W latach 2005-11 nabożeństwa sprawowane były w górnym kościele, ukończonym w stanie surowym. Pod koniec roku 2011 parafia powróciła do kościoła dolnego, a w górnym podjęte zostały kompleksowe prace wykończeniowe.
30 kwietnia 2022 roku, Ksiądz Arcybiskup Józef Guzdek, Metropolita Białostocki, w obecności Księdza Arcybiskupa Edwarda Ozorowskiego i Księdza Biskupa Henryka Ciereszki, dokonał aktu poświęcenia górnego kościoła pw. Świętej Rodziny.
Nasi parafianie (jest ich około 5500) to w większości osoby starsze, mieszkające na Osiedlu Sienkiewicza od kilkudziesięciu lat. Dużą część mieszkańców osiedla stanowią osoby wynajmujące tymczasowo mieszkania. Parafianie korzystają z posługi kapłańskiej nie tylko w kościele parafialnym, ale także w kaplicy przy ul. Poleskiej, gdzie sprawowana jest codzienna Eucharystia.
Księża z naszej parafii pełnią duszpasterską posługę w Szpitalu MSWiA oraz w Szpitalu Miejskim. Na terenie parafii znajduje się kilka szkół i przedszkoli, w których nauczają religii katolickiej katechetki świeckie.

Na terenie naszej parafii znajduje się kaplica Zgromadzenia Sióstr Jezusa Miłosiernego, która przez wiele lat miała rangę kościoła parafialnego. Z miejscem tym, poprzez pełnienie kapłańskiej posługi, codzienne życie i przejście do wieczności był mocno związany bł. ks. Michał Sopoćko. W kaplicy sprawowana jest codzienna Eucharystia. Oprócz naszych parafian w kaplicy spotykają się (systematycznie i okazjonalnie) różne grupy z całego miasta, a także czciciele Miłosierdzia Bożego spoza Białegostoku i Archidiecezji Białostockiej.

Z kultem Miłosierdzia Bożego i osobą bł. ks. Michała Sopoćki związany jest także Krzyż przy ul. Poleskiej (w okolicach ul. Wąskiej), w miejscu, w którym w roku 1989 wykoleił się pociąg z cysternami przewożącymi ciekły chlor.